אפרת אשכנזי נולדה בישראל. למדה בבית הספר הגבוה לאמנויות הבמה בית צבי וסיימה תואר במוסיקולוגיה ובמדעי הרוח באוניברסיטת בר אילן. זכתה במלגות המכון הישראלי לאמנויות האופרה וכן במלגות אלי ליאון, בסר, קרן רונן ומלגת סנו. אפרת אשכנזי היתה חברה במיתר אופרה סטודיו של האופרה הישראלית שם הרפרטואר שלה כלל את הרוזנת בנישואי פיגרו, ויטליה ברחמיו של טיטוס, הגבירה הראשונה בחליל הקסם (מוצרט), רוזלינדה בעטלף (י. שטראוס), מימי בלה בוהם (פוצ'יני), האימא בהנזל וגרטל (הומפרדינק) ועוד. ביצעה את רוזלינדה בעטלף (י. שטראוס) עם התזמורת הסימפונית חיפה.

תפקידיה באופרה הישראלית:
איש השעה (2016)

לה רונדינה: ביאנקה (2015)
שיקוי האהבה: ג'נטה (2015)

לה בוהם: מימי (2014)
דון ג'ובני: דונה אנה (2014) - עכו
מאדאם בטרפליי (2014) - הבלט הישראלי

הילד חולם: האישה המנחמת / תשיעייה (2012) - סיור לפסטיבל מאי ויסבאדן

ינופה: אשת ראש העיר (2012)
עלייתה ונפילתה של העיר מהגוני: נערה (2012)
אאידה: הכוהנת הגדולה (2010) - מצדה
ארנני: ג'ובאנה (2011)
חליל הקסם: הגבירה ראשונה (2011)  
לה טרוויאטה: אנינה (2011)
ליידי מקבת ממצנסק: אסירה (2011)